A、花由不同的组织构成，属于器官．A错误；
B、番茄表皮是由形态相似，结构、功能相同的细胞联合在一起形成的，有保护作用，属于保护组织．B正确；
C、心脏不同的组织构成，属于器官．C错误；
D、苹果不同的组织构成，属于器官．D错误．
故选：B