从句应当用 which has been living with us since thousands of years ago
从句不用过去完成时,应该用现在完成进行时.因为那些动植物现在还在与我们一同生活,并且将来还要与我们一同生活
如果简单的去掉since,从时间上正确了.但意思是好象那些动植物只在几千年前与我们一起生活,现在已经不了,意思不正确