只有重力（万有引力）或只有弹力做功时，机械能守恒．
A、飞船升空阶段发动机做功，机械能增加，故A错误．
B、飞船在椭圆轨道上绕地球运行的阶段，只有引力做功，机械能守恒，故B正确．
C、在太空中返回舱与轨道舱分离后，在大气层以外向着地球做无动力飞行过程中只有重力（万有引力）做功，机械能守恒，故C正确；
D、进入大气层并运动一段时间后，降落伞张开，返回舱下降过程中，要克服空气阻力做功，机械能减小，故D错误．
故选：BC．