线粒体呼吸链酶一共有5个,他们分别是NADH（也称为复合物I）、琥珀酸氧化还原酶（也称为复合物II）、细胞色素C氧化还原酶（复合物III）、细胞色素C还原酶（也称为复合物IV）和ATP合成酶（也称为复合物V）.
在生物细胞中,接受代谢物上脱下的氢(或电子)的载体有三种—— NAD+、NADP+ 和FAD.
　　其中NADPH不进入呼吸链合成ATP,而是作为生物合成的还原剂；只有NADH和FADH2进入呼吸链.
　　由于线粒体中需要经呼吸链氧化和电子传递的主要是NADH,而FADH2较少,可将呼吸链分为主、次呼吸链.
　　主呼吸链（NADH呼吸链）——由NADH开始的呼吸链
　　由复合物Ⅰ、Ⅲ和Ⅳ构成,从NADH来的电子依次经过这三个复合物,进行传递.
　　次呼吸（FADH2呼吸链）——由FADH2开始的呼吸链
　　由复合物Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ构成,来自FADH2的电子不经过复合物Ⅰ.