目前所用的载体有细菌的质粒(如大肠杆菌质粒)、噬菌体或病毒,更多的是经过人工改造的一些载体.用于分子克隆的载体都应具备下述条件：① 在细胞内能自主复制,即具有复制原点,可以使所携带的外源DNA在受体细胞内忠实地复制；② 有适宜的限制酶切位点.最好是对多种限制酶有单一切点,且酶切位点不在复制原点内 ③具备对重组体易于检测的选择性遗传标记.除上述的基本条件外,根据实验的需要,人们还常希望载体具有其他的各种特征.如携带外源DNA的幅度较宽,具备可促进外源DNA高水平表达的调控区；为保证安全,载体在特定宿主细胞外不能生存,以及某些特殊的筛选指标等等.