标记基因的功能是为了方便我们更容易挑选被转化的个体.虽然直接检测转化子产物确定转化子从理论上来说可以,但是其数量之多工作量之大成本之高,决定了不可能采取这一方式进行转化个体筛选.举个例子,在载体构建或农杆菌转化植株时,一次转化就能得到成百上千个菌落/愈伤,如果要按照“筛选细胞产物”,那么得检测每个菌落/愈伤的表达情况,也就意味着上千次PCR/HPLC/WB操作;而采用抗性培养基,长出来的菌落/愈伤基本就是转化子,其节省的成本和工作量是极大的.现在的发展方向是采用表达无害产物的筛选基因(如显色或营养缺陷),或采用同源重组的方式在挑选好的转化子中去除标记基因.这样能进一步克服使用抗生素抗性筛选基因带来的抗生素抗性风险的缺陷.
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