A、基因非编码区对基因的表达起着重要的调控作用，因此对于抗虫基因在棉花细胞中的表达不可缺少，A正确；
B、重组DNA分子中增加一个碱基对，如果该碱基对处于基因非编码区，则毒蛋白的毒性可能不会丧失，B正确；
C、转基因作物可通过花粉将外源基因传递到近缘作物，从而造成基因污染，C正确；
D、转基因棉花是否具有抗虫特性，应该直接用害虫来食用棉花叶片，做毒性检测；抗生素抗性检测往往用于对标记基因进行检测，以确定外源基因是否导入受体细胞，D错误．
故选：D．