种子中储存着大量种子萌发时所需要的营养物质，其中主要的在脂肪、淀粉、蛋白质，种子萌发时这些大分子物质需要水解成小分子物质才能被利用，脂肪的水解需要脂肪酶，淀粉水解需要淀粉酶、蛋白质水解需要蛋白酶的催化，因此种子萌发时，贮藏物质发生水解作用过程中，活性最高的酶应该是脂肪酶、淀粉酶、蛋白酶．
故选：A．