A、真核生物葡萄糖的彻底氧化分解发生在细胞质基质和线粒体，而原核生物（如好氧菌）则发生在细胞质基质，A错误；
B、原核生物（如蓝藻）没有叶绿体，其糖类的合成不在叶绿体中，B错误；
C、硝化细菌没有线粒体，有氧呼吸在细胞质基质进行，C错误；
D、淀粉酶的化学本质是蛋白质，肯定在核糖体上合成，D正确．
故选：D．